Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CETPP11597 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CETPP11597 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CETPP11597 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CETPP11597 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CETPP11597 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CETPP11597 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CETPP11597 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CETPP11597 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CETPP11597 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CETPP11597 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CETPP11597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CETPP11597 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CETPP11597 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CETPP11597 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CETPP11597 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CETPP11597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CETPP11597 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CETPP11597 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CETPP11597 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CETPP11597 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms