Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GZMBP10144 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GZMBP10144 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GZMBP10144 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GZMBP10144 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GZMBP10144 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GZMBP10144 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GZMBP10144 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GZMBP10144 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GZMBP10144 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms