Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB1P08034 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB1P08034 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB1P08034 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB1P08034 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB1P08034 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB1P08034 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GJB1P08034 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB1P08034 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GJB1P08034 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GJB1P08034 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GJB1P08034 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms