Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HLA-DQB2P05538 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HLA-DQB2P05538 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms