Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
EGFRP00533 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
EGFRP00533 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EGFRP00533 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
EGFRP00533 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
EGFRP00533 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
EGFRP00533 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EGFRP00533 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
EGFRP00533 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
EGFRP00533 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
EGFRP00533 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
EGFRP00533 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
EGFRP00533 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
EGFRP00533 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
EGFRP00533 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
EGFRP00533 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
EGFRP00533 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
EGFRP00533 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EGFRP00533 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
EGFRP00533 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EGFRP00533 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
EGFRP00533 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms