Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MBD3O95983 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MBD3O95983 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MBD3O95983 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MBD3O95983 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
MBD3O95983 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MBD3O95983 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MBD3O95983 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MBD3O95983 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MBD3O95983 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MBD3O95983 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD3O95983 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD3O95983 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD3O95983 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD3O95983 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MBD3O95983 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MBD3O95983 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MBD3O95983 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms