Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP10AO60312 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP10AO60312 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ATP10AO60312 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ATP10AO60312 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ATP10AO60312 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ATP10AO60312 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms