Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
KIAA0556O60303 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
KIAA0556O60303 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
KIAA0556O60303 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms