Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP5O60239 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SH3BP5O60239 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SH3BP5O60239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms