Protein–RNA interactions for Protein: O13559

YRF1-4, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-4O13559 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 EXO1YOR033C 2109 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 TAF5YBR198C 2397 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 PHM7YOL084W 2976 nt5.58□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 KIN2YLR096W 3444 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 CNB1YKL190W 528 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YER158CYER158C 1722 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 DNF2YDR093W 4839 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 MPH2YDL247W 1830 nt5.57□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt5.56□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 PDR16YNL231C 1056 nt5.56□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 VAN1YML115C 1608 nt5.56□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 KRE6YPR159W 2163 nt5.56□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 HNT2YDR305C 654 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YEL045CYEL045C 426 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YCR023CYCR023C 1836 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 PGM2YMR105C 1710 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 ADY3YDL239C 2373 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 API2YDR525W 330 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 RSA3YLR221C 663 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 ECM33YBR078W 1290 nt5.55□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 ARH1YDR376W 1482 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 NTA1YJR062C 1374 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 RIP1YEL024W 648 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YIR043CYIR043C 693 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 TEF4YKL081W 1239 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 COG5YNL051W 1212 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 PDX3YBR035C 687 nt5.54□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 SUL2YLR092W 2682 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 TFC7YOR110W 1308 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 MMR1YLR190W 1476 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 CPR1YDR155C 489 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 RPL12AYEL054C 498 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 LSO1YJR005C-A 282 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 ADD37YMR184W 597 nt5.53□□□□□ -1.52
YRF1-4O13559 CLA4YNL298W 2529 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 ASP1YDR321W 1146 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 RMR1YGL250W 726 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 CDC12YHR107C 1224 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 CWC25YNL245C 540 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 FRE7YOL152W 1863 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 COP1YDL145C 3606 nt5.52□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YHR182WYHR182W 2358 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 RAM1YDL090C 1296 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 HST4YDR191W 1113 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YKL107WYKL107W 930 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YAL047W-AYAL047W-A 330 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 MRPL3YMR024W 1173 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 DIT1YDR403W 1611 nt5.51□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 NGL2YMR285C 1548 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 CAB3YKL088W 1716 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 PMT2YAL023C 2280 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 FHL1YPR104C 2811 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 IMA1YGR287C 1770 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 COQ4YDR204W 1008 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 NTR2YKR022C 969 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 IMA3YIL172C 1770 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 IMA4YJL221C 1770 nt5.5□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 HIS4YCL030C 2400 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 HOS2YGL194C 1359 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 NUP2YLR335W 2163 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 snR7-SsnR7-S 179 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YDL228CYDL228C 642 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 FBP1YLR377C 1047 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 OSW5YMR148W 447 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YOR131CYOR131C 657 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 APC1YNL172W 5247 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 AIM21YIR003W 2040 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 GPI18YBR004C 1302 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 SWC3YAL011W 1878 nt5.49□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 UBA2YDR390C 1911 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 TDA7YNL176C 1911 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 LCB2YDR062W 1686 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 APE1YKL103C 1545 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 SUR2YDR297W 1050 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 GRX4YER174C 735 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 RNA15YGL044C 891 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YHR212W-AYHR212W-A 204 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 YJR096WYJR096W 849 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 FMP46YKR049C 402 nt5.48□□□□□ -1.53
YRF1-4O13559 TVP38YKR088C 1014 nt5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.1 ms