Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PITPNM1O00562 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PITPNM1O00562 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PITPNM1O00562 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms