Protein–RNA interactions for Protein: H3BU86

STX16-NPEPL1, STX16-NPEPL1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX16-NPEPL1H3BU86 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX16-NPEPL1H3BU86 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STX16-NPEPL1H3BU86 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STX16-NPEPL1H3BU86 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms