Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC10BA6NIK2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC10BA6NIK2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRRC10BA6NIK2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms