Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LCHNA4D1U4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LCHNA4D1U4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LCHNA4D1U4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms