Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LAMB4A4D0S4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LAMB4A4D0S4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMB4A4D0S4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LAMB4A4D0S4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms