Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GGCXP38435 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GGCXP38435 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms