Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 MYRF-202ENST00000278836 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HELTA6NFD8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms