Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNA2P51530 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms