Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATP4AP20648 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms