Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSC1Q92574 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSC1Q92574 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSC1Q92574 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 IQUB-202ENST00000466202 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TSN-201ENST00000389682 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 HERC3-203ENST00000407637 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MARCH10-201ENST00000311269 3090 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TSC1Q92574 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms