Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC012087.1-201ENST00000608068 809 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CFTRP13569 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EFHB-202ENST00000344838 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AC114812.4-201ENST00000506676 757 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 Metazoa_SRP.147-201ENST00000576563 312 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 URGCP-MRPS24-201ENST00000603700 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CFTRP13569 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CFTRP13569 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 TAMM41-201ENST00000273037 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AKT3-IT1-201ENST00000417120 517 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 MCRS1-203ENST00000546244 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CFTRP13569 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms