Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZBED1O96006 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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