Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
IFT52Q9Y366 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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IFT52Q9Y366 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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IFT52Q9Y366 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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IFT52Q9Y366 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
IFT52Q9Y366 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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