Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PLD5-204ENST00000442594 3305 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FGFR1-208ENST00000397108 2870 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GUCD1-213ENST00000621833 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 IL36RN-202ENST00000393200 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 C2-211ENST00000469372 1906 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HNRNPF-202ENST00000356053 2670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 C1R-209ENST00000542285 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GPALPP1-202ENST00000361121 3410 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RAPGEF3-201ENST00000389212 3294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 DPH2-201ENST00000255108 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM131A-201ENST00000310585 3677 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 JMJD7-PLA2G4B-201ENST00000342159 2966 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LDLR-205ENST00000557933 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 UTP3-201ENST00000254803 2073 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 MYT1-203ENST00000536311 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RBMX-201ENST00000320676 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 LINC02140-202ENST00000566649 2017 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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UBE2V1Q13404 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RIMS2-207ENST00000504942 4228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 URGCP-205ENST00000443736 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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UBE2V1Q13404 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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UBE2V1Q13404 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 SOCS6-201ENST00000397942 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 AL162615.1-201ENST00000429893 1653 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
UBE2V1Q13404 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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