Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UTP11Q9Y3A2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms