Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
MED27Q6P2C8 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
MED27Q6P2C8 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms