Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SIX1Q15475 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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