Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
FOXE3Q13461 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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FOXE3Q13461 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
FOXE3Q13461 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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