Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
LOXL1Q08397 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms