Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms