Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CASP4P49662 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CASP4P49662 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms