Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 POLR2H-202ENST00000429568 878 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC008799.2-201ENST00000484429 647 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC092535.2-201ENST00000513176 1204 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SDHD-205ENST00000528048 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AMN1-212ENST00000542781 879 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL163195.2-203ENST00000553604 573 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC010680.5-201ENST00000605021 463 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MND1-206ENST00000622785 830 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC022400.7-201ENST00000625041 1236 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 FAM122C-201ENST00000370784 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
HOXB1P14653 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 SNCA-202ENST00000345009 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HOXB1P14653 AC092474.1-201ENST00000416158 1167 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms