Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PACSIN2Q9UNF0 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms