Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CTDSPL2Q05D32 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms