Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RPL31P11-201ENST00000426558 1558 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
TNP2Q05952 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ANKRD30BL-202ENST00000409867 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC012493.1-201ENST00000453252 760 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RPL12P33-201ENST00000485633 492 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HTATIP2-206ENST00000531058 1060 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC012150.1-201ENST00000553075 593 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC134407.1-201ENST00000577385 709 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC092683.1-209ENST00000612970 1105 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
TNP2Q05952 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms