Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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HOXC13P31276 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HOXC13P31276 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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