Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PTPRFP10586 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FAM227B-212ENST00000561064 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 KF455155.1-201ENST00000604493 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PTPRFP10586 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms