Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CCDC192P0DO97 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms