Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FRMD1-205ENST00000440994 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SLC6A10P-201ENST00000330048 3846 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ZBTB42-201ENST00000342537 3800 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM214B-208ENST00000605244 3016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MAN2C1-242ENST00000569482 3177 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RIC1-204ENST00000418622 6658 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SKAP2O75563 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms