Protein–RNA interactions for Protein: Q9P298

HIGD1B, HIG1 domain family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1BQ9P298 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ARID4A-206ENST00000431317 5783 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 APOBR-202ENST00000564831 3792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 MAP7-208ENST00000617204 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ZNF606-201ENST00000341164 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 CPA5-208ENST00000485477 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 TXNDC2-202ENST00000357775 2830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 ACO2-202ENST00000396512 2811 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
HIGD1BQ9P298 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NT5C3AP1-202ENST00000441170 1663 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CTAGE13P-201ENST00000416709 2446 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 LINC01544-201ENST00000567801 5168 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AGPAT1-204ENST00000395496 2103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PCDHGA9-201ENST00000573521 4605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FBXW11-201ENST00000265094 4342 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TTC39A-202ENST00000262676 6287 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SEPT10-202ENST00000397712 3071 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ELMOD3-202ENST00000393852 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PHF19-202ENST00000373896 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 LINC00642-201ENST00000419459 2026 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TOLLIP-207ENST00000527886 3666 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 WSCD2-201ENST00000332082 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 TMEM104-204ENST00000582330 4679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CSNK1G3-201ENST00000345990 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 CAMTA2-204ENST00000414043 4589 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
HIGD1BQ9P298 ATP6V1B1-201ENST00000234396 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms