Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

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Length 1,298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AMBRA1Q9C0C7 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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AMBRA1Q9C0C7 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
AMBRA1Q9C0C7 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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