Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SIN3AQ96ST3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms