Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LETM2Q2VYF4 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LETM2Q2VYF4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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