Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CASC19-229ENST00000641418 1373 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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FOXC1Q12948 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXC1Q12948 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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