Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC15Q0P6D6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.1 ms