Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 RAI1-AS1-201ENST00000443696 724 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RN7SL202P-201ENST00000584410 262 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 C10orf90-207ENST00000480379 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GACAT2-201ENST00000579368 818 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TEX33-203ENST00000405091 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GLI3P10071 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI3P10071 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GLI3P10071 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms