Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM38O00635 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TRIM38O00635 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM38O00635 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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