Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
L1RE1Q9UN81 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms