Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms