Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SNX12-202ENST00000374274 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MON1B-201ENST00000248248 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms